MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 11341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009613	T	7	7	62	68	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009613	TTA	2	6	76	81	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009613	A	6	6	86	91	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009613	AAGGA	2	10	105	114	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009613	A	6	6	114	119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009613	TAA	2	6	163	168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009613	A	6	6	205	210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009613	TAA	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009613	A	6	6	232	237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009613	T	6	6	261	266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009613	TAA	2	6	295	300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009613	ATT	2	6	311	316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009613	TAAATT	2	12	317	328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009613	T	7	7	332	338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009613	AT	3	6	340	345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009613	A	6	6	366	371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009613	ATA	2	6	380	385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009613	TCTAA	2	10	399	408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009613	TTA	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009613	TAT	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009613	TAT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009613	CTC	2	6	462	467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009613	T	6	6	3417	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009613	AAT	2	6	3423	3428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009613	A	10	10	3435	3444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009613	ATT	2	6	3468	3473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009613	ATTA	2	8	3499	3506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009613	A	6	6	3506	3511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009613	TAAA	2	8	4209	4216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009613	A	7	7	4214	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009613	ACG	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009613	TTAG	2	8	4319	4326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009613	TAA	2	6	4351	4356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009613	T	6	6	4377	4382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009613	A	6	6	4383	4388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009613	ATTA	2	8	4397	4404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009613	TAAT	2	8	4413	4420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009613	TCAA	2	8	4822	4829	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009613	T	7	7	4853	4859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009613	ATA	2	6	6981	6986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009613	TAAA	2	8	6994	7001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009613	A	6	6	6999	7004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009613	TAT	2	6	7027	7032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009613	ATTAT	2	10	7050	7059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009613	TAA	2	6	7060	7065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009613	TTA	2	6	7073	7078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009613	TAA	2	6	7103	7108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009613	A	6	6	7113	7118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009613	A	8	8	7144	7151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009613	A	6	6	7198	7203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009613	ACA	2	6	7234	7239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009613	TAAT	2	8	7263	7270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009613	A	7	7	7275	7281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009613	T	6	6	8228	8233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009613	TGT	2	6	9311	9316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009613	ATTT	2	8	9319	9326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009613	ATT	3	9	9360	9368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009613	AT	3	6	11473	11478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009613	TAC	2	6	11504	11509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009613	T	6	6	15321	15326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009613	T	6	6	15330	15335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009613	TAAG	2	8	15337	15344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009613	T	6	6	15398	15403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009613	TTAA	2	8	15409	15416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009613	TAA	2	6	15440	15445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009613	TAAA	2	8	17472	17479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009613	T	6	6	17480	17485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009613	TTAAA	2	10	17497	17506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009613	AT	3	6	18424	18429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009613	A	7	7	18440	18446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009613	A	6	6	18471	18476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009613	CAA	2	6	18571	18576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009613	A	8	8	18596	18603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009613	A	7	7	18634	18640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009613	T	8	8	19219	19226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009613	A	6	6	19227	19232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009613	T	6	6	19257	19262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009613	TA	3	6	19280	19285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009613	T	6	6	19294	19299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009613	ATA	2	6	19344	19349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009613	GCC	2	6	19422	19427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009613	TTACT	2	10	19437	19446	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009613	TAA	2	6	19512	19517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009613	A	7	7	19526	19532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009613	TGA	2	6	19545	19550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009613	TAC	2	6	19560	19565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009613	ATATG	2	10	19568	19577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009613	ATT	2	6	19612	19617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009613	AGTA	2	8	19626	19633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009613	A	6	6	19644	19649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009613	A	6	6	19669	19674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009613	TAA	2	6	19689	19694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009613	TA	4	8	19747	19754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009613	A	6	6	19786	19791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009613	ATT	2	6	19878	19883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009613	A	6	6	19892	19897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009613	A	6	6	19906	19911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009613	AAT	2	6	19920	19925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009613	AGA	2	6	19941	19946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009613	TCT	2	6	19952	19957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009613	A	7	7	20030	20036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009613	A	6	6	22534	22539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009613	TAA	2	6	22544	22549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009613	TAAA	2	8	22554	22561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009613	TTTTA	2	10	22599	22608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009613	T	6	6	22680	22685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009613	AAT	2	6	22694	22699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009613	A	7	7	22705	22711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009613	AAG	2	6	22722	22727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009613	ATT	2	6	22737	22742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009613	A	6	6	22757	22762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009613	A	7	7	22775	22781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009613	T	6	6	22784	22789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009613	CATCT	2	10	22794	22803	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009613	AAAT	2	8	22825	22832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009613	TA	3	6	22851	22856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009613	T	7	7	25150	25156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009613	GAA	2	6	25216	25221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009613	TTA	2	6	25299	25304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009613	TGT	2	6	25309	25314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009613	T	7	7	25348	25354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009613	TAG	2	6	25402	25407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009613	TAC	2	6	25517	25522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009613	AAT	2	6	25541	25546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009613	GAA	2	6	25573	25578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009613	TTA	2	6	25618	25623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009613	TGT	2	6	25628	25633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009613	TGA	2	6	25672	25677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009613	T	8	8	25711	25718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009613	TCT	2	6	25779	25784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009613	AGCA	2	8	25788	25795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009613	ATT	2	6	25871	25876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009613	T	7	7	25895	25901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009613	ATT	2	6	25959	25964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009613	T	6	6	25963	25968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009613	T	6	6	26567	26572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009613	TTGA	2	8	26587	26594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009613	GTT	2	6	27530	27535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009613	T	9	9	27534	27542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009613	AAT	2	6	27550	27555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009613	T	7	7	27579	27585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009613	TAAAA	2	10	27592	27601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009613	GTT	2	6	27624	27629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009613	AAT	2	6	27632	27637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009613	TAG	2	6	28816	28821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009613	TGC	2	6	28850	28855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009613	T	6	6	28862	28867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009613	T	8	8	28875	28882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009613	TTTGT	2	10	28894	28903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009613	A	8	8	28946	28953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009613	A	7	7	28972	28978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009613	T	6	6	29004	29009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009613	T	7	7	29023	29029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009613	AGAA	2	8	29074	29081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_009613	T	6	6	52806	52811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_009613	A	6	6	134214	134219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_009613	T	7	7	134252	134258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_009613	TTTTAA	2	12	134272	134283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_009613	TAA	3	9	134373	134381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_009613	T	6	6	134472	134477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_009613	ATTAA	2	10	134487	134496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_009613	A	6	6	134535	134540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_009613	AAAT	2	8	134619	134626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_009613	TAA	2	6	136698	136703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_009613	TAA	2	6	136832	136837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_009613	T	7	7	139029	139035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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